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污染是細(xì)胞培養(yǎng)的大敵。防備和避免污染是細(xì)胞培養(yǎng)成功的關(guān)鍵之一。一開端就要十分重視，避免污染，不然會(huì)前功盡棄，不只糟蹋時(shí)間，并且糟蹋人力、物力，乃至構(gòu)成無法彌補(bǔ)的丟失。 細(xì)胞培養(yǎng)中常見的生物污染類型有 7 種，分別是細(xì)菌污染、支原體污染、原蟲污染、黑膠蟲污染、真菌污染、病毒污染以及非細(xì)胞污染。他們?cè)诩?xì)胞培養(yǎng)中污染的特色如下：
1. 細(xì)菌：細(xì)菌在一般倒置顯微鏡下為黑色細(xì)沙狀，根據(jù)感染細(xì)菌的不同，可有不同的外形，培養(yǎng)液一般會(huì)污濁變黃，對(duì)細(xì)胞成長(zhǎng)影響顯著。
2. 支原體：黑色的，好象多為多形，培養(yǎng)液一般培養(yǎng)液一般會(huì)污濁，原體感染，國內(nèi)血清許多都沒有做支原體陰性檢測(cè)，而支原體是牛血清中最常見的微生物之一。并且它不能用過濾的方法除掉。支原體感染細(xì)胞今后，細(xì)胞病變不很顯著，僅僅漸漸死去。
3. 黑膠蟲：能夠穿透濾膜，也能夠經(jīng)過空氣傳達(dá)，低倍下為黑色點(diǎn)狀，高倍下可看見黑色的小蟲游來游去，培養(yǎng)液也是不渾的，一般不會(huì)太影響，細(xì)胞仍是能夠用的。常常是細(xì)胞成長(zhǎng)狀況杰出，且觀測(cè)到的運(yùn)動(dòng)物無顯著增多，且培養(yǎng)液顏色、透明度無顯著變化，可在同一批號(hào)的血清養(yǎng)的細(xì)胞中發(fā)現(xiàn)類似現(xiàn)象。對(duì)細(xì)胞成長(zhǎng)狀況不會(huì)有顯著影響，在細(xì)胞增殖旺盛之后會(huì)自然消失，除替換血清外無須特別處理。
4. 真菌：一般培養(yǎng)液清亮，不變色，鏡下有絲狀物，有些真菌開端很像死細(xì)胞碎片，僅僅它許多許多的小塊很清楚，象珊瑚狀，不象細(xì)胞碎片分不清，漸漸的會(huì)長(zhǎng)出很細(xì)的黑色絲狀物。真菌成長(zhǎng)的比較慢，不象細(xì)菌那么簡(jiǎn)單被發(fā)現(xiàn)，可是一旦發(fā)現(xiàn)有它的存在細(xì)胞就被污染了，也很難救活了。
5. 原蟲：培養(yǎng)液可細(xì)微污濁，顯微鏡下那些細(xì)微的點(diǎn)狀物數(shù)量十分多，細(xì)微活動(dòng)，細(xì)胞雖然能夠成長(zhǎng)但繁衍速度卻顯著減慢，并且細(xì)胞狀況欠好，邊際不清楚，細(xì)胞不透亮。他們與細(xì)胞可共生但會(huì)與細(xì)胞搶奪養(yǎng)分。這種共生是十分遍及的，但他們的數(shù)量小，細(xì)胞站優(yōu)勢(shì)所以不會(huì)影響到細(xì)胞的正常成長(zhǎng)，只有當(dāng)他們抵達(dá)必定的數(shù)量時(shí)就會(huì)影響到細(xì)胞的成長(zhǎng)，終究構(gòu)成惡性循環(huán)。
6. 病毒：安排細(xì)胞培養(yǎng)過程中，假如沒有除掉潛在的病毒，就會(huì)發(fā)作病毒污染?，F(xiàn)在，從原代猴腎細(xì)胞的培養(yǎng)中已發(fā)現(xiàn)不少于 20 種血清性病毒。 雖然病毒污染的細(xì)胞不影響原代培養(yǎng)，但出產(chǎn)疫苗是不安全的。因而，潛在病毒是細(xì)胞大量出產(chǎn)和疫苗、干擾素等生物制品制作中的難題
7. 非同種細(xì)胞污染 ：便是細(xì)胞穿插污染，因?yàn)榧?xì)胞培養(yǎng)操作時(shí)各細(xì)胞株所需的器件和溶液沒有嚴(yán)格分開，往往會(huì)使一種細(xì)胞被另一種細(xì)胞污染。現(xiàn)在，世界上已有幾十種細(xì)胞都被 HeLa 細(xì)胞所污染，致使許多實(shí)驗(yàn)宣告無效。非細(xì)胞培養(yǎng)物所構(gòu)成的化學(xué)成分的污染也偶有發(fā)作，大多是因?yàn)榧?xì)胞培養(yǎng)所需物品清洗消毒不完全而帶入一些有毒化學(xué)物質(zhì)所造成的。 在上述的八種污染物中，黑膠蟲是現(xiàn)代細(xì)胞培養(yǎng)中評(píng)論比較多的，但大多數(shù)文獻(xiàn)未對(duì)其進(jìn)行描繪或一帶而過，就像上面關(guān)于描繪黑膠蟲的狀況是不完整，還有許多不明的狀況。對(duì)其身份有多種猜想，到現(xiàn)在都沒有權(quán)威地對(duì)黑膠蟲進(jìn)行分類學(xué)上的歸類。黑膠蟲究竟是不是一種生物，假如是那黑膠蟲會(huì)是何種生物，假如不是，那黑膠蟲會(huì)是什么？一系列的問題都懸在斗爭(zhēng)在細(xì)胞生物學(xué)范疇的學(xué)者們的心中。